因为朱厚照只要求孔门嫡系族人赔补，因而曲阜的大多数孔姓庶民也都也没能被孔闻韶组织起来，当然，锦衣卫出现的太突然，也让孔闻韶无法组织，何况，孔姓庶民也不一定会愿意跟着自己嫡系族人造朝廷的反。
所以，孔闻韶只垂头丧气地把锦衣卫们请进了孔府。
锦衣卫自然也没客气，以最快最彻底的速度把孔闻韶、孔闻礼、孔文运等嫡系族人的家产都抄没了出来，但让锦衣卫惊讶的是，光是孔文运一族的资产就已经不下两百万，加上孔闻韶与孔闻礼两兄弟的资产就已经达到价值八百万银元。
当然，这些资产包括了所有的田产地契店铺等。
朱厚照也没想到孔家还真能查抄出这么多财物来，他本以为七百万银元能够把孔家赔的倾家荡产最终成为庶民，但他没想到居然人家家底雄厚到嫡系族人都已有不下八百万的族产！要知道八百万银元，和六百多万两白银没多大的区别，这可是朝廷正德初年时国库的三倍多收入。
山东巡抚潘珍倒也没想到自己的谏言竟然让陛下换了种方式找孔家要赔偿金，直接动用锦衣卫而且只查抄嫡系族人。
这一下子，就等于潘珍这个山东巡抚虽然收了孔闻韶的好处，但并没有帮到孔闻韶，而且反而让孔闻韶遭受到更大的损失！连把赔偿金转移到其他族人身上的机会都没有。
当然，山东巡抚潘珍也没有因此有什么愧疚之心。
在他看来，自己这个巡抚官对上算是提了个好建议，对于自己也收了三千银元，而至于孔家被查抄，他自然也不会太在意，也最多同情一下，同时也遗憾一下，遗憾皇帝没有让他这个巡抚查抄孔府，那样他就可以通过查抄得到更多的好处。
朱厚照也知道当官的没一个是善茬，他能猜到山东巡抚潘珍可能也会与孔家有什么勾连，但他也一时拿不出证据来，即便他是皇帝也不能一次性把整个大明官场变得清廉如水，儒以文乱法，侠以武犯禁，自己这个皇帝也不能以皇权独裁而这些官员劣迹显现之前，因为怀疑而问罪。
但对于已经罪证确凿的人，朱厚照则自然不会饶恕，不然就足以警戒一干不老实的人。
孔文运被朱厚照判处了凌迟之刑。
而跟着孔文运一同谋划操纵粮价案与烧毁漕粮案的其他犯人也被判处了凌迟之刑。
连带永昌侯也被判为了斩立决。
对于刑部尚书聂震，朱厚照也没有放过，直接批道：
“身为大明之大司空，执掌法令，却知法犯法，于牢中谋害他人，还意图包庇嫌犯，欺君瞒上，罪加一等，即判车裂！抄没其家，其父母妻儿之封荫全部摒除！”
“陛下，聂震到底是朝廷重臣，虽有罪但也不应如此严治呀，臣冒死替聂公求情，恳请陛下收回成命啊！”
康海这时候匍匐在朱厚照面前回道，因为在康海看来，本来刑不上大夫都是常例，就算是罪大恶极者也最多弃市斩首，毕竟聂震是刑部尚书啊，而且又不是谋反弑君，直接车裂不可谓不严酷！
此时，同康海一起来禀报事务的礼部尚书欧阳旦也匍匐了下来：
“陛下，臣亦冒死替聂公求情，他虽知法犯法，欺君罔上，但亦不应如此严苛呀！严刑峻法到底非国之善政啊，陛下！”
“朕本有意逐步减轻律令之严酷，不以严刑峻法治国，但是聂震这件事让朕意识到，民智未开不仅仅是指的庶民民智未开，连带着你们，还有那个企图帮孔家逃避罪责且意图欺上瞒下的刑部尚书聂震！也是民智未开！你们都给朕站起来！”
朱厚照指着跪在自己面前的几位阁臣尚书吼道。
康海与欧阳旦只得站了起来，一时不知道陛下为何说自己这些朝廷官员也民智未开。
“他聂震身为刑部尚书，应当只知道依律处置才是，也正因为此，当他谏言应把孔文运等嫌犯按照程序转到刑部时，朕同意了他，可他却仗着自己是刑部尚书大行职务之便，还暗杀疑犯，想瞒天过海！包庇孔家！他到底是我大明之臣还是孔家之奴！”
“这种刑部尚书就是民智未开，不知道律法治国之观念！也不知道国家利益至上之观念！只知维护道统！另外，还有你们，怎么，以为自己是朝廷重臣，然后跪下来向朕求情，朕就应该大为触动，对他聂震从宽处理？
你们已经是一品大员，朕让你们站起来很难吗，非要动不动跪下，难不成你们就喜欢跪下？！”
朱厚照怒吼了起来，他是真的发现所谓的民智未开不仅仅是指的只是庶民，朝中这些学问渊博的进士文官何尝不是民智未开？
连眼前这些内阁大学士在与自己这个帝王意见不和时想到的都只是以下跪的方式逼迫帝王妥协，以为舍弃尊严就可以让皇帝服软，而不是以严密的逻辑分析来建言。
康海与欧阳旦都站了起来，他们也没想到陛下如此震怒，一时不由得有些害怕起来，但让他们更害怕的是不知道自己陛下是因为谁因为什么而生气，因而，他们现在又果断秒怂，缩紧脖子，等着皇帝朱厚照坐下一步的指示。
朱厚照见自己这两个近臣一脸疑惑又一脸害怕的样子，一时也不知道该如何训斥，只得直接吩咐道：“听旨！大学士康海监刑，立即对聂震执刑！”
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